Irati é banhado por uma extensa rede de drenagem com vergência dominante para o sudoeste, sentido ao rio Iguaçu, dentro da qual existem os rios Preto, Riozinho, Mato Queimado, Imbituvinha, Taquari, Guamirim, Corrente, Campinas, Cachoeira e Caçador.

Com vergência para o norte, fazendo parte da bacia do rio Ivaí, existem os rios Valeiros, Linha B, Guabiroba, dos Patos, dos Cochos, dos Antonios, do Couro, Canhadão, das Antas, da Prata, do Cobre, da Areia, Caratuva, Bonito e Barreiro.